Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe40O35185 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms