Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx3O35160 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms