Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scarb2O35114 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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