Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cldn4O35054 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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