Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms