Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltaO08585 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltaO08585 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltaO08585 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltaO08585 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltaO08585 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltaO08585 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltaO08585 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltaO08585 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltaO08585 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltaO08585 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CltaO08585 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltaO08585 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltaO08585 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltaO08585 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltaO08585 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CltaO08585 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CltaO08585 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CltaO08585 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CltaO08585 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CltaO08585 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CltaO08585 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CltaO08585 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CltaO08585 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CltaO08585 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CltaO08585 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CltaO08585 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CltaO08585 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltaO08585 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltaO08585 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltaO08585 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CltaO08585 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltaO08585 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltaO08585 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltaO08585 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltaO08585 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltaO08585 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltaO08585 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltaO08585 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltaO08585 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CltaO08585 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CltaO08585 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CltaO08585 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CltaO08585 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CltaO08585 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CltaO08585 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CltaO08585 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CltaO08585 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CltaO08585 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CltaO08585 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CltaO08585 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CltaO08585 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CltaO08585 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CltaO08585 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CltaO08585 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CltaO08585 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms