Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec22bO08547 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms