Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp955bL7N232 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp955bL7N232 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms