Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3402K7N5P2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3402K7N5P2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms