Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer2J3QPU5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccer2J3QPU5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms