Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm21972J3QN38 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm21972J3QN38 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm21972J3QN38 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21972J3QN38 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms