Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm20918J3QN17 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm20918J3QN17 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm20918J3QN17 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm20918J3QN17 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm20918J3QN17 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm20918J3QN17 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm20918J3QN17 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20918J3QN17 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20918J3QN17 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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