Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a18J3QN01 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a18J3QN01 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms