Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm6594J3QM43 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm6594J3QM43 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm6594J3QM43 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm6594J3QM43 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm6594J3QM43 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm6594J3QM43 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm6594J3QM43 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm6594J3QM43 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm6594J3QM43 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm6594J3QM43 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm6594J3QM43 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm6594J3QM43 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm6594J3QM43 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm6594J3QM43 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6594J3QM43 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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