Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6176J3QK59 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms