Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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