Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnmal2G3X9N3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnmal2G3X9N3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms