Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp72F8VQC1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms