Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3443F7CCV5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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