Protein–RNA interactions for Protein: F7BY56

Gm8138, Predicted gene 8138 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8138F7BY56 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8138F7BY56 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8138F7BY56 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms