Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms