Protein–RNA interactions for Protein: F6Y363

Gm6665, Predicted gene 6665, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6665F6Y363 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6665F6Y363 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6665F6Y363 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6665F6Y363 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6665F6Y363 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6665F6Y363 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6665F6Y363 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6665F6Y363 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6665F6Y363 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6665F6Y363 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6665F6Y363 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6665F6Y363 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6665F6Y363 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6665F6Y363 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6665F6Y363 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6665F6Y363 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms