Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17093F6XGJ4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17093F6XGJ4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms