Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm28305F6U473 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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