Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cald1E9QA15 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms