Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A430078G23RikE9Q7Y4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms