Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc85cE9Q6B2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms