Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20518E9Q548 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms