Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd1E9Q3H4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd1E9Q3H4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms