Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r238E9Q373 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms