Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Ccdc171E9Q1U1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc171E9Q1U1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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