Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdzd2E9Q1M1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd2E9Q1M1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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