Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Gm3893E9Q1I1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Gm3893E9Q1I1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Gm3893E9Q1I1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3893E9Q1I1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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Gm3893E9Q1I1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Gm3893E9Q1I1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3893E9Q1I1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms