Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myo5cE9Q1F5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myo5cE9Q1F5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
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