Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdr1E9Q0B4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdr1E9Q0B4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms