Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fndc1E9Q043 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fndc1E9Q043 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms