Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx60E9PZQ1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ddx60E9PZQ1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx60E9PZQ1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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