Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sfta2E9PXB6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms