Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3002E9PW72 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3002E9PW72 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms