Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD3

Dchs1, Protocadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 3,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dchs1E9PVD3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dchs1E9PVD3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dchs1E9PVD3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dchs1E9PVD3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dchs1E9PVD3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dchs1E9PVD3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms