Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ttc17E9PVB5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc17E9PVB5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms