Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Piezo1E2JF22 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Piezo1E2JF22 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Piezo1E2JF22 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Piezo1E2JF22 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Piezo1E2JF22 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Piezo1E2JF22 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Piezo1E2JF22 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Piezo1E2JF22 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Piezo1E2JF22 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Piezo1E2JF22 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Piezo1E2JF22 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms