Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930444G20RikD3Z741 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930444G20RikD3Z741 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms