Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5478D3Z6R0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5478D3Z6R0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms