Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
5430403G16RikD3Z5L4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
5430403G16RikD3Z5L4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 788.4 ms