Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rexo5D3YW29 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rexo5D3YW29 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms