Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc13D3YV10 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc13D3YV10 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms