Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmf1B9EKI3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmf1B9EKI3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms