Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Clip3B9EHT4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms