Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20547B8JJN0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Gm20547B8JJN0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Gm20547B8JJN0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gm20547B8JJN0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gm20547B8JJN0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm20547B8JJN0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm20547B8JJN0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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